Madrid - 03 abr 2008: El Centro de Investigación TJ Watson de IBM, junto con un grupo de investigadores de la Universidad de Edimburgo, ha anunciado la puesta en marcha de un proyecto conjunto de investigación, que utilizará simulaciones de supercomputación combinadas con experimentos de laboratorio para acelerar el diseño de fármacos dirigidos a la inhibición de la infección por el virus VIH.
El proyecto, en el que se trabajará durante un período aproximado de cinco años, combina la tecnología de computación, incluyendo el supercomputador Blue Gene de IBM, con técnicas experimentales dirigidas al propio proceso de infección. El objetivo es diseñar inhibidores de la parte del virus responsable de permitir que el material genético del mismo acceda a las células humanas.
La novedad de esta iniciativa de colaboración reside en el intento de diseñar simultáneamente múltiples inhibidores y, de esta forma, prevenir la mutación del virus y las consecuencias que ello puede tener sobre la salud.
“Nuestros primeros resultados son prometedores y muestran que podemos utilizar los ordenadores para simular qué moléculas pueden detener el virus VIH de la infección en seres humanos. Esto podría ayudar a los laboratorios a desarrollar más rápidamente ese tipo de fármacos”, explica Jason Crain de la Escuela de Ciencia Físicas de Edimburgo y jefe de la división de Ciencias en el Laboratorio Nacional de Física en el Reino Unido. “Esto representa una nueva aproximación al diseño de fármacos, ya que estamos utilizando conjuntamente algoritmos complejos y técnicas experimentales, para diseñar terapias moleculares mejoradas. Asimismo, permite extraer mayor partido a la capacidad de los supercomputadores para hacer esto de manera más racional y eficiente”.
En la senda de una vacuna contra el virus VIH
Este proyecto se centra en cómo el virus humano VIH-1 ataca las células humanas e inyecta su material genético. Los investigadores están examinando un fragmento de la proteína de superficie del virus, conocida como péptido, que resulta crucial para simular la respuesta del cuerpo inmune al ataque viral. Entender la estructura y comportamiento del péptido permitirá diseñar múltiples fármacos simultáneamente capaces de orientar el proceso de infección.
“Uno de los mayores desafíos para la comunidad médica es encontrar una vacuna contra el virus VIH”, expone Glenn Martyna, investigador de IBM. “Combinando la investigación experimental de la Universidad de Edimburgo y las capacidades de simulación del supercomputador más potente del mundo, el Blue Gene, podríamos estar cada vez más cerca de este objetivo”.
La Universidad de Edimburgo está a la vanguardia de los avances en la alta computación y provee la más amplia gama de instalaciones para supercomputación de las universidades europeas. En 2004, la Universidad instaló el primer superordenador Blue Gene de IBM en Europa en un intento por ayudar a los investigadores de Reino Unido a abordar algunos de los más desafiantes enigmas de la ciencia.
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